Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HADHQ16836 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms