Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms