Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms