Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CARTPTQ16568 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms