Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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