Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SSX1Q16384 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX1Q16384 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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