Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETFDHQ16134 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms