Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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