Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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