Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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