Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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COL19A1Q14993 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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