Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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