Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
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