Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms