Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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