Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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UBE4AQ14139 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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UBE4AQ14139 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE4AQ14139 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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