Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms