Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms