Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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