Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms