Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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