Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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