Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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