Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLAMF1Q13291 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLAMF1Q13291 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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