Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RIGQ13278 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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