Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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