Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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