Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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