Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NFIAQ12857 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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