Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX4Q12846 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms