Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms