Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms