Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf54Q08AI8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms