Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms