Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms