Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms