Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXM1Q08050 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms