Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms