Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms