Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A11Q02978 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms