Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB1Q02818 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms