Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ID3Q02535 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ID3Q02535 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ID3Q02535 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ID3Q02535 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms