Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms