Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms