Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms