Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms