Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2BQ00403 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms