Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms