Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARF3P61204 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF3P61204 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms