Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms